Quem tiver um video e o arquivo de legenda e deseja unir ambos num aquivo o comando é este :

mencoder -oac mp3lame -ovc lavc -sub legenda.srt video.avi -o videocomlegenda.avi

Sintaxe :

mencoder ( programa que acompanha o mplayer capaz de ripar e outras coisas )

-oac (Qual sera o codec de audio no arquivo que seja criado, usando a opção help é possivel ter uma lista ex.: mencoder -oac help )

-ovc (Qual sera o codec de video no arquivo que seja criado, usando a opção help é possivel ter uma lista ex.: mencoder -ovc help )

-sub ( para especificar o arquivo de legendas )

-o ( arquivo de saida que sera gerado)

Também é possível mudar as opções e fazer com que o arquivo gerado seja um rip de DVD mas isso eu mostro em outra ocasião ;)